Wir verwenden Cookies, um Ihnen ein optimales Webseiten-Erlebnis zu bieten. Dazu zählen Cookies, die für den Betrieb der Seite notwendig sind, sowie solche, die lediglich zu anonymen Statistikzwecken, für Komforteinstellungen oder zur Anzeige personalisierter Inhalte genutzt werden. Sie können selbst entscheiden, welche Kategorien Sie zulassen möchten. Bitte beachten Sie, dass auf Basis Ihrer Einstellungen womöglich nicht mehr alle Funktionalitäten der Seite zur Verfügung stehen. Weitere Informationen finden Sie in unseren Datenschutzhinweisen .

Essentiell aktivieren/deaktivieren

Diese Cookies sind für die Funktionalität unserer Website erforderlich und können nicht deaktiviert werden.

Name	Webedition CMS
Zweck	Dieses Cookie wird vom CMS (Content Management System) Webedition für die unverwechselbare Identifizierung eines Anwenders gesetzt. Es bietet dem Anwender bessere Bedienerführung, z.B. Speicherung von Sucheinstellungen oder Formulardaten. Typischerweise wird dieses Cookie beim Schließen des Browsers gelöscht.
Name	econda
Zweck	Session-Cookie für die Webanalyse Software econda. Diese läuft im Modus „Anonymisiertes Messen“.

Statistik aktivieren/deaktivieren

Diese Cookies helfen uns zu verstehen, wie Besucher mit unserer Webseite interagieren, indem Informationen anonym gesammelt und analysiert werden. Je nach Tool werden ein oder mehrere Cookies des Anbieters gesetzt.

Name	econda
Zweck	Measure with Visitor Cookie emos_jcvid

Externe Medien aktivieren/deaktivieren

Inhalte von externen Medienplattformen werden standardmäßig blockiert. Wenn Cookies von externen Medien akzeptiert werden, bedarf der Zugriff auf diese Inhalte keiner manuellen Zustimmung mehr.

Name	YouTube
Zweck	Zeige YouTube Inhalte
Name	Twitter
Zweck	Twitter Feeds aktivieren

Dr. Stefan Dentro

Journal Article Herms, A. ; Fernandez-Antoran, D. ; Alcolea, M. P. ; Kalogeropoulou, A. ; Banerjee, U. ; Piedrafita, G. ; Abby, E. ; Valverde-Lopez, J. A. ; Ferreira, I. S. ; Caseda, I. ; Bejar, M. T. ; Dentro, S. C.DKFZ* ; Vidal-Notari, S. ; Ong, S. H. ; Colom, B. ; Murai, K. ; King, C. ; Mahbubani, K. ; Saeb-Parsy, K. ; Lowe, A. R. ; Gerstung, M.DKFZ* ; Jones, P. H.
Self-sustaining long-term 3D epithelioid cultures reveal drivers of clonal expansion in esophageal epithelium.
Nature genetics nn, nn (2024) [10.1038/s41588-024-01875-8]2024 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Baker, T. M. ; Lai, S. ; Lynch, A. R. ; Lesluyes, T. ; Yan, H. ; Ogilvie, H. A. ; Verfaillie, A. ; Dentro, S.DKFZ* ; Bowes, A. L. ; Pillay, N. ; Flanagan, A. M. ; Swanton, C. ; Spellman, P. T. ; Tarabichi, M. ; Van Loo, P.
The history of chromosomal instability in genome doubled tumors.
Cancer discovery 14(10), 1810-1822 (2024) [10.1158/2159-8290.CD-23-1249]2024 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article De Zuani, M. ; Xue, H. ; Park, J. S. ; Dentro, S. C.DKFZ* ; Seferbekova, Z. ; Tessier, J. ; Curras-Alonso, S. ; Hadjipanayis, A. ; Athanasiadis, E. I. ; Gerstung, M.DKFZ* ; Bayraktar, O. ; Cvejic, A.
Single-cell and spatial transcriptomics analysis of non-small cell lung cancer.
Nature Communications 15(1), 4388 (2024) [10.1038/s41467-024-48700-8]2024 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Jakobsdottir, G. M. ; Dentro, S. C.DKFZ* ; Bristow, R. G. ; Wedge, D. C.
AmplificationTimeR: An R Package for Timing Sequential Amplification Events.
Bioinformatics 40(6), btae281 (2024) [10.1093/bioinformatics/btae281]2024 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Abby, E. ; Dentro, S.DKFZ* ; Hall, M. W. J. ; Fowler, J. C. ; Ong, S. H. ; Sood, R. ; Herms, A. ; Piedrafita, G. ; Abnizova, I. ; Siebel, C. W. ; Gerstung, M.DKFZ* ; Hall, B. A. ; Jones, P. H.
Notch1 mutations drive clonal expansion in normal esophageal epithelium but impair tumor growth
Nature genetics 55(2), 232-245 (2023) [10.1038/s41588-022-01280-z]2023 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article (Erratum/Correction) Rubanova, Y. ; Shi, R. ; Harrigan, C. F. ; et al
Author Correction: Reconstructing evolutionary trajectories of mutation signature activities in cancer using TrackSig
Nature Communications 13(1), 7567 (2022) [10.1038/s41467-022-32336-7]2022 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Lomakin, A. (First author)DKFZ* ; Svedlund, J. ; Strell, C. ; Gataric, M. ; Shmatko, A.DKFZ* ; Rukhovich, G.DKFZ* ; Park, J. S.DKFZ* ; Ju, Y. S. ; Dentro, S.DKFZ* ; Kleshchevnikov, V. ; Vaskivskyi, V. ; Li, T. ; Bayraktar, O. A. ; Pinder, S. ; Richardson, A. L. ; Santagata, S. ; Campbell, P. J. ; Russnes, H. ; Gerstung, M.DKFZ* ; Nilsson, M. ; Yates, L. R.
Spatial genomics maps the structure, nature and evolution of cancer clones.
Nature <London> 611(7936), 594 - 602 (2022) [10.1038/s41586-022-05425-2]2022 pmc Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Preprint Murai, K. ; Dentro, S.Extern* ; Ong, S. H. ; Sood, R. ; Fernandez-Antoran, D. ; Herms, A. ; Kostiou, V. ; Hall, B. A. ; Gerstung, M.Extern* ; Jones, P. H.
p53 mutation in normal esophagus promotes multiple stages of carcinogenesis but is constrained by clonal competition
[10.1101/2022.02.03.478951] BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Demeulemeester, J. ; Dentro, S.Extern* ; Gerstung, M.Extern* ; Van Loo, P.
Biallelic mutations in cancer genomes reveal local mutational determinants.
Nature genetics 54(2), 128 - 133 (2022) [10.1038/s41588-021-01005-8]2022 pmc Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Dentro, S.Extern* ; Leshchiner, I. ; Haase, K. ; et al
Characterizing genetic intra-tumor heterogeneity across 2,658 human cancer genomes
Cell 184(8), 2239 - 2254.e39 (2021) [10.1016/j.cell.2021.03.009]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Preprint Abby, E. ; Dentro, S.Extern* ; Hall, M. W. J. ; Fowler, J. C. ; Ong, S. H. ; Sood, R. ; Siebel, C. W. ; Gerstung, M.Extern* ; Hall, B. A. ; Jones, P. H.
Notch1 mutation drives clonal expansion in normal esophageal epithelium but impairs tumor growth
[10.1101/2021.06.18.448956] BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Preprint Lomakin, A.Extern* ; Svedlund, J. ; Strell, C. ; Gataric, M. ; Shmatko, A. ; Park, J. S. ; Ju, Y. S. ; Dentro, S.Extern* ; Kleshchevnikov, V. ; Vaskivskyi, V. ; Li, T. ; Bayraktar, O. A. ; Moore, L. ; Pinder, S. ; Richardson, A. L. ; Campbell, P. J. ; Gerstung, M.Extern* ; Nilsson, M. ; Yates, L. R.
Spatial genomics maps the structure, character and evolution of cancer clones
[10.1101/2021.04.16.439912] BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Colom, B. ; Herms, A. ; Hall, M. W. J. ; Dentro, S.Extern* ; King, C. ; Sood, R. K. ; Alcolea, M. P. ; Piedrafita, G. ; Fernandez-Antoran, D. ; Ong, S. H. ; Fowler, J. C. ; Mahbubani, K. T. ; Saeb-Parsy, K. ; Gerstung, M.Extern* ; Hall, B. A. ; Jones, P. H.
Mutant clones in normal epithelium outcompete and eliminate emerging tumours.
Nature <London> 598(7881), 510 - 514 (2021) [10.1038/s41586-021-03965-7]2021 pmc Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Fowler, J. C. ; King, C. ; Bryant, C. ; Hall, M. W. J. ; Sood, R. ; Ong, S. H. ; Earp, E. ; Fernandez-Antoran, D. ; Koeppel, J. ; Dentro, S.Extern* ; Shorthouse, D. ; Durrani, A. ; Fife, K. ; Rytina, E. ; Milne, D. ; Roshan, A. ; Mahububani, K. ; Saeb-Parsy, K. ; Hall, B. A. ; Gerstung, M. ; Jones, P. H.
Selection of Oncogenic Mutant Clones in Normal Human Skin Varies with Body Site.
Cancer discovery 11(2), 340 - 361 (2021) [10.1158/2159-8290.CD-20-1092]2021 pmc Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Anderson, N. D. ; Babichev, Y. ; Fuligni, F. ; Comitani, F. ; Layeghifard, M. ; Venier, R. E. ; Dentro, S.Extern* ; Maheshwari, A. ; Guram, S. ; Wunker, C. ; Thompson, J. D. ; Yuki, K. E. ; Hou, H. ; Zatzman, M. ; Light, N. ; Bernardini, M. Q. ; Wunder, J. S. ; Andrulis, I. L. ; Ferguson, P. ; Razak, A. R. A. ; Swallow, C. J. ; Dowling, J. J. ; Al-Awar, R. S. ; Marcellus, R. ; Rouzbahman, M. ; Gerstung, M.Extern* ; Durocher, D. ; Alexandrov, L. B. ; Dickson, B. C. ; Gladdy, R. A. ; Shlien, A.
Lineage-defined leiomyosarcoma subtypes emerge years before diagnosis and determine patient survival.
Nature Communications 12(1), 4496 (2021) [10.1038/s41467-021-24677-6]2021 DBCoverage Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Ansari-Pour, N. ; Zheng, Y. ; Yoshimatsu, T. F. ; Sanni, A. ; Ajani, M. ; Reynier, J.-B. ; Tapinos, A. ; Pitt, J. J. ; Dentro, S.Extern* ; Woodard, A. ; Rajagopal, P. S. ; Fitzgerald, D. ; Gruber, A. J. ; Odetunde, A. ; Popoola, A. ; Falusi, A. G. ; Babalola, C. P. ; Ogundiran, T. ; Ibrahim, N. ; Barretina, J. ; Van Loo, P. ; Chen, M. ; White, K. P. ; Ojengbede, O. ; Obafunwa, J. ; Huo, D. ; Wedge, D. C. ; Olopade, O. I.
Whole-genome analysis of Nigerian patients with breast cancer reveals ethnic-driven somatic evolution and distinct genomic subtypes.
Nature Communications 12(1), 6946 (2021) [10.1038/s41467-021-27079-w]2021 DBCoverage Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Li, C. H. ; Prokopec, S. D. ; Sun, R. X. ; et al
Sex differences in oncogenic mutational processes
Nature Communications 11(1), 4330 (2020) [10.1038/s41467-020-17359-2]2020 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Salcedo, A. ; Tarabichi, M. ; Espiritu, S. M. G. ; et al
A community effort to create standards for evaluating tumor subclonal reconstruction.
Nature biotechnology 38(1), 97 - 107 (2020) [10.1038/s41587-019-0364-z]2020 pmc Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Moore, L. ; Leongamornlert, D. ; Coorens, T. H. H. ; Sanders, M. A. ; Ellis, P. ; Dentro, S.Extern* ; Dawson, K. J. ; Butler, T. ; Rahbari, R. ; Mitchell, T. J. ; Maura, F. ; Nangalia, J. ; Tarpey, P. S. ; Brunner, S. F. ; Lee-Six, H. ; Hooks, Y. ; Moody, S. ; Mahbubani, K. T. ; Jimenez-Linan, M. ; Brosens, J. J. ; Iacobuzio-Donahue, C. A. ; Martincorena, I. ; Saeb-Parsy, K. ; Campbell, P. J. ; Stratton, M. R.
The mutational landscape of normal human endometrial epithelium.
Nature <London> 580(7805), 640 - 646 (2020) [10.1038/s41586-020-2214-z]2020 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Colom, B. ; Alcolea, M. P. ; Piedrafita, G. ; Hall, M. W. J. ; Wabik, A. ; Dentro, S.Extern* ; Fowler, J. C. ; Herms, A. ; King, C. ; Ong, S. H. ; Sood, R. K. ; Gerstung, M.Extern* ; Martincorena, I. ; Hall, B. A. ; Jones, P. H.
Spatial competition shapes the dynamic mutational landscape of normal esophageal epithelium.
Nature genetics 52(6), 604 - 614 (2020) [10.1038/s41588-020-0624-3]2020 pmc Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Bailey, M. H. ; Meyerson, W. U. ; Dursi, L. J. ; et al
Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samples.
Nature Communications 11(1), 4748 (2020) [10.1038/s41467-020-18151-y]2020 DBCoverage Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Watkins, T. B. K. ; Lim, E. L. ; Petkovic, M. ; et al
Pervasive chromosomal instability and karyotype order in tumour evolution.
Nature <London> 587(7832), 126-132 (2020) [10.1038/s41586-020-2698-6]2020 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Rodriguez-Martin, B. ; Alvarez, E. G. ; Baez-Ortega, A. ; et al
Pan-cancer analysis of whole genomes identifies driver rearrangements promoted by LINE-1 retrotransposition.
Nature genetics 52(3), 306-319 (2020) [10.1038/s41588-019-0562-0]2020 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Preprint Dentro, S.Extern* ; Leshchiner, I. ; Haase, K. ; Tarabichi, M. ; Wintersinger, J. ; Deshwar, A. G. ; Yu, K. ; Rubanova, Y. ; Macintyre, G. ; Demeulemeester, J. ; Vázquez-García, I. ; Kleinheinz, K.DKFZ* ; Livitz, D. G. ; Malikic, S. ; Donmez, N. ; Sengupta, S. ; Anur, P. ; Jolly, C. ; Cmero, M. ; Rosebrock, D. ; Schumacher, S. ; Fan, Y. ; Fittall, M. ; Drews, R. M. ; Yao, X. ; Lee, J. ; Schlesner, M.DKFZ* ; Zhu, H. ; Adams, D. J. ; Getz, G. ; Boutros, P. C. ; Imielinski, M. ; Beroukhim, R. ; Sahinalp, S. C. ; Ji, Y. ; Peifer, M. ; Martincorena, I. ; Markowetz, F. ; Mustonen, V. ; Yuan, K. ; Gerstung, M.Extern* ; Spellman, P. T. ; Wang, W. ; Morris, Q. D. ; Wedge, D. C. ; Van Loo, P.
Characterizing genetic intra-tumor heterogeneity across 2,658 human cancer genomes
[10.1101/312041] BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article (Letter) Tarabichi, M. ; Martincorena, I. ; Gerstung, M.Extern* ; et al
Neutral tumor evolution?
Nature genetics 50(12), 1630 - 1633 (2018) [10.1038/s41588-018-0258-x]2018 pmc Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Wedge, D. C. ; Gundem, G. ; Mitchell, T. ; et al
Sequencing of prostate cancers identifies new cancer genes, routes of progression and drug targets.
Nature genetics 50(5), 682 - 692 (2018) [10.1038/s41588-018-0086-z]2018 pmc Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Preprint Rodriguez-Martin, B. ; Alvarez, E. G. ; Baez-Ortega, A. ; et al
Pan-cancer analysis of whole genomes reveals driver rearrangements promoted by LINE-1 retrotransposition in human tumours
[10.1101/179705] BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Abbosh, C. ; Birkbak, N. J. ; Wilson, G. A. ; et al
Phylogenetic ctDNA analysis depicts early-stage lung cancer evolution.
Nature <London> 545(7655), 446 - 451 (2017) [10.1038/nature22364]2017 pmc Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Rabbie, R. ; Rashid, M. ; Arance, A. M. ; Sánchez, M. ; Tell-Marti, G. ; Potrony, M. ; Conill, C. ; van Doorn, R. ; Dentro, S.Extern* ; Gruis, N. A. ; Corrie, P. ; Iyer, V. ; Robles-Espinoza, C. D. ; Puig-Butille, J. A. ; Puig, S. ; Adams, D. J.
Genomic analysis and clinical management of adolescent cutaneous melanoma.
Pigment cell & melanoma research 30(3), 307 - 316 (2017) [10.1111/pcmr.12574]2017 pmc Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Jamal-Hanjani, M. ; Wilson, G. A. ; McGranahan, N. ; et al
Tracking the Evolution of Non-Small-Cell Lung Cancer.
The New England journal of medicine 376(22), 2109 - 2121 (2017) [10.1056/NEJMoa1616288]2017 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Dentro, S.Extern* ; Wedge, D. C. ; Van Loo, P.
Principles of Reconstructing the Subclonal Architecture of Cancers.
Cold Spring Harbor perspectives in medicine 7(8), a026625 - (2017) [10.1101/cshperspect.a026625]2017 pmc Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Linch, M. ; Goh, G. ; Hiley, C. ; Shanmugabavan, Y. ; McGranahan, N. ; Rowan, A. ; Wong, Y. N. S. ; King, H. ; Furness, A. ; Freeman, A. ; Linares, J. ; Akarca, A. ; Herrero, J. ; Rosenthal, R. ; Harder, N. ; Schmidt, G. ; Wilson, G. A. ; Birkbak, N. J. ; Mitter, R. ; Dentro, S.Extern* ; Cathcart, P. ; Arya, M. ; Johnston, E. ; Scott, R. ; Hung, M. ; Emberton, M. ; Attard, G. ; Szallasi, Z. ; Punwani, S. ; Quezada, S. A. ; Marafioti, T. ; Gerlinger, M. ; Ahmed, H. U. ; Swanton, C.
Intratumoural evolutionary landscape of high-risk prostate cancer: the PROGENY study of genomic and immune parameters.
Annals of oncology 28(10), 2472 - 2480 (2017) [10.1093/annonc/mdx355]2017 pmc Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article McGranahan, N. ; Rosenthal, R. ; Hiley, C. T. ; et al
Allele-Specific HLA Loss and Immune Escape in Lung Cancer Evolution
Cell 171(6), 1259 - 1271.e11 (2017) [10.1016/j.cell.2017.10.001]2017 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Sandhu, V. ; Wedge, D. C. ; Bowitz Lothe, I. M. ; Labori, K. J. ; Dentro, S.Extern* ; Buanes, T. ; Skrede, M. L. ; Dalsgaard, A. M. ; Munthe, E. ; Myklebost, O. ; Lingjærde, O. C. ; Børresen-Dale, A.-L. ; Ikdahl, T. ; Van Loo, P. ; Nord, S. ; Kure, E. H.
The Genomic Landscape of Pancreatic and Periampullary Adenocarcinoma.
Cancer research 76(17), 5092 - 5102 (2016) [10.1158/0008-5472.CAN-16-0658]2016 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Ameziane, N. ; Sie, D. ; Dentro, S.Extern* ; Ariyurek, Y. ; Kerkhoven, L. ; Joenje, H. ; Dorsman, J. C. ; Ylstra, B. ; Gille, J. J. P. ; Sistermans, E. A. ; de Winter, J. P.
Diagnosis of fanconi anemia: mutation analysis by next-generation sequencing.
Anemia 2012, 1 - 7 (2012) [10.1155/2012/132856]2012 DBCoverage Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

powered by webEdition CMS