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Artem Shmatko

Journal Article Jin, D. (First author)DKFZ* ; Liang, S. ; Shmatko, A.DKFZ* ; Arnold, A. ; Horst, D.DKFZ* ; Grünewald, T.DKFZ* ; Gerstung, M.DKFZ* ; Bai, X.
Teacher-student collaborated multiple instance learning for pan-cancer PDL1 expression prediction from histopathology slides.
Nature Communications 15(1), 3063 (2024) [10.1038/s41467-024-46764-0]2024 DBCoverage Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Lomakin, A. (First author)DKFZ* ; Svedlund, J. ; Strell, C. ; Gataric, M. ; Shmatko, A.DKFZ* ; Rukhovich, G.DKFZ* ; Park, J. S.DKFZ* ; Ju, Y. S. ; Dentro, S.DKFZ* ; Kleshchevnikov, V. ; Vaskivskyi, V. ; Li, T. ; Bayraktar, O. A. ; Pinder, S. ; Richardson, A. L. ; Santagata, S. ; Campbell, P. J. ; Russnes, H. ; Gerstung, M.DKFZ* ; Nilsson, M. ; Yates, L. R.
Spatial genomics maps the structure, nature and evolution of cancer clones.
Nature <London> 611(7936), 594 - 602 (2022) [10.1038/s41586-022-05425-2]2022 pmc Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article (Review Article) Shmatko, A. (First author)DKFZ* ; Ghaffari Laleh, N. ; Gerstung, M.DKFZ* ; Kather, J. N.
Artificial intelligence in histopathology: enhancing cancer research and clinical oncology.
Nature cancer 3(9), 1026 - 1038 (2022) [10.1038/s43018-022-00436-4]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Kleshchevnikov, V. ; Shmatko, A.Extern* ; Dann, E. ; Aivazidis, A. ; King, H. W. ; Li, T. ; Elmentaite, R. ; Lomakin, A.Extern* ; Kedlian, V. ; Gayoso, A. ; Jain, M. S. ; Park, J. S. ; Ramona, L. ; Tuck, E. ; Arutyunyan, A. ; Vento-Tormo, R. ; Gerstung, M.Extern* ; James, L. ; Stegle, O.DKFZ* ; Bayraktar, O. A.
Cell2location maps fine-grained cell types in spatial transcriptomics
Nature biotechnology 40(5), 661-671 (2022) [10.1038/s41587-021-01139-4]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Preprint Kleshchevnikov, V. ; Shmatko, A.Extern* ; Dann, E. ; Aivazidis, A. ; King, H. W. ; Li, T. ; Lomakin, A.Extern* ; Kedlian, V. ; Jain, M. S. ; Park, J. S. ; Ramona, L. ; Tuck, E. ; Arutyunyan, A. ; Vento-Tormo, R. ; Gerstung, M.Extern* ; James, L. ; Stegle, O.DKFZ* ; Bayraktar, O. A.
Comprehensive mapping of tissue cell architecture via integrated single cell and spatial transcriptomics
bioRxiv (2020) [10.1101/2020.11.15.378125]2020 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Fu, Y. ; Jung, A. W. ; Torne, R. V. ; Gonzalez, S. ; Vöhringer, H. ; Shmatko, A.Extern* ; Yates, L. R. ; Jimenez-Linan, M. ; Moore, L. ; Gerstung, M.Extern*
Pan-cancer computational histopathology reveals mutations, tumor composition and prognosis
Nature cancer 1(8), 800 - 810 (2020) [10.1038/s43018-020-0085-8]2020 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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