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Publications 2022

Peterziel, H. (First author) ; Jamaladdin, N. ; ElHarouni, D. ; Gerloff, X. ; Herter, S. ; Fiesel, P. ; Berker, Y. ; Blattner-Johnson, M. ; Schramm, K. ; Jones, B. ; Reuss, D. ; Turunen, L. ; Friedenauer, A. ; Holland-Letz, T. ; Sill, M. ; Weiser, L. ; Previti, C. ; Balasubramanian, G. ; Gerber, N. U. ; Gojo, J. ; Hutter, C. ; Øra, I. ; Lohi, O. ; Kattamis, A. ; de Wilde, B. ; Westermann, F. ; Tippelt, S. ; Graf, N. ; Nathrath, M. ; Sparber-Sauer, M. ; Sehested, A. ; Kramm, C. M. ; Dirksen, U. ; Kallioniemi, O. ; Pfister, S. ; van Tilburg, C. M. ; Jones, D. ; Saarela, J. ; Pietiäinen, V. ; Jäger, N. ; Schlesner, M. ; Kopp-Schneider, A. ; Oppermann, S. ; Milde, T. ; Witt, O. (Last author) ; Oehme, I. (Last author)
Drug sensitivity profiling of 3D tumor tissue cultures in the pediatric precision oncology program INFORM.
npj precision oncology 6(1), 94 (2022) [10.1038/s41698-022-00335-y]2022 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Clarkson, B. D. ; Johnson, R. K. ; Bingel, C. ; Lothaller, C. ; Howe, C. L.
Preservation of antigen-specific responses in cryopreserved CD4+ and CD8+ T cells expanded with IL-2 and IL-7.
Journal of translational autoimmunity 5, 100173 (2022) [10.1016/j.jtauto.2022.100173]2022 DBCoverage Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Pearson, A. D. ; Allen, C. ; Fangusaro, J. ; Hutter, C. ; Witt, O. (First author) ; Weiner, S. ; Reaman, G. ; Russo, M. ; Bandopadhayay, P. ; Ahsan, S. ; Barone, A. ; Barry, E. ; de Rojas, T. ; Fisher, M. ; Fox, E. ; Bender, J. G. ; Gore, L. ; Hargrave, D. ; Hawkins, D. ; Kreider, B. ; Langseth, A. J. ; Lesa, G. ; Ligas, F. ; Marotti, M. ; Marshall, L. V. ; Nasri, K. ; Norga, K. ; Nysom, K. ; Pappo, A. ; Rossato, G. ; Scobie, N. ; Smith, M. ; Stieglitz, E. ; Weigel, B. ; Weinstein, A. ; Viana, R. ; Karres, D. ; Vassal, G.
Paediatric Strategy Forum for medicinal product development in mitogen-activated protein kinase pathway inhibitors
European journal of cancer 177, 120 - 142 (2022) [10.1016/j.ejca.2022.09.036]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Berker, Y. ; ElHarouni, D. ; Peterziel, H. ; Fiesel, P. ; Witt, O. ; Oehme, I. ; Schlesner, M. ; Oppermann, S. (Last author)
Patient-by-Patient Deep Transfer Learning for Drug-Response Profiling Using Confocal Fluorescence Microscopy of Pediatric Patient-Derived Tumor-Cell Spheroids
IEEE transactions on medical imaging 41(12), 3981-3999 (2022) [10.1109/TMI.2022.3205554]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Steimbach, R. (First author) ; Herbst-Gervasoni, C. J. ; Lechner, S. ; Stewart, T. M. ; Klinke, G. ; Ridinger, J. ; Geraldy, M. ; Tihanyi, G. ; Foley, J. R. ; Uhrig, U. ; Kuster, B. ; Poschet, G. ; Casero, R. A. ; Médard, G. ; Oehme, I. ; Christianson, D. W. ; Gunkel, P. N. ; Miller, A. (Last author)
Aza-SAHA Derivatives Are Selective Histone Deacetylase 10 Chemical Probes That Inhibit Polyamine Deacetylation and Phenocopy HDAC10 Knockout.
Journal of the American Chemical Society 144(41), 18861-18875 (2022) [10.1021/jacs.2c05030]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Langenberg, K. P. S. ; Meister, M. T. ; Bakhuizen, J. J. ; et al
Implementation of paediatric precision oncology into clinical practice: The Individualized Therapies for Children with cancer program 'iTHER'.
European journal of cancer 175, 311 - 325 (2022) [10.1016/j.ejca.2022.09.001]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Ivanova, E. (First author) ; Costa, B. ; Eisemann, T. ; Lohr, S. ; Boskovic, P. ; Eichwald, V. ; Meckler, J. ; Jugold, M. ; Orian-Rousseau, V. ; Peterziel, H. ; Angel, P. (Last author)
CD44 expressed by myeloid cells promotes glioma invasion.
Frontiers in oncology 12, 969787 (2022) [10.3389/fonc.2022.969787]2022 DBCoverage Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Pfister, S. (First author) ; Witt, O. ; Jones, D. (Last author)
Pediatric precision oncology-Time for clinical prime time.
Med 3(8), 521 - 522 (2022) [10.1016/j.medj.2022.07.004]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Thomale, U.-W. ; Gnekow, A. K. ; Kandels, D. ; Bison, B. ; Hernáiz Driever, P. ; Witt, O. ; Pietsch, T. ; Koch, A. ; Capper, D. ; Kortmann, R.-D. ; Timmermann, B. ; Harrabi, S. ; Simon, M. ; El Damaty, A. ; Krauss, J. ; Schuhmann, M. U. ; Aigner, A.
Long-term follow-up of surgical intervention pattern in pediatric low-grade gliomas: report from the German SIOP-LGG 2004 cohort.
Journal of neurosurgery / Pediatrics 30(3), 316?329 (2022) [10.3171/2022.6.PEDS22108]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Darwish, S. ; Ghazy, E. ; Heimburg, T. ; Herp, D. ; Zeyen, P. ; Salem-Altintas, R. ; Ridinger, J. ; Robaa, D. ; Schmidtkunz, K. ; Erdmann, F. ; Schmidt, M. ; Romier, C. ; Jung, M. ; Oehme, I. ; Sippl, W.
Design, Synthesis and Biological Characterization of Histone Deacetylase 8 (HDAC8) Proteolysis Targeting Chimeras (PROTACs) with Anti-Neuroblastoma Activity
International journal of molecular sciences 23(14), 7535 (2022) [10.3390/ijms23147535]2022 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Tsai, J. W. ; Cejas, P. ; Wang, D. K. ; Patel, S. ; Wu, D. W. ; Arounleut, P. ; Wei, X. ; Zhou, N. ; Syamala, S. ; Dubois, F. P. B. ; Crane, A. ; Pelton, K. ; Vogelzang, J. ; Sousa, C. ; Baguette, A. ; Chen, X. ; Condurat, A. L. ; Dixon-Clarke, S. E. ; Zhou, K. N. ; Lu, S. D. ; Gonzalez, E. M. ; Chacon, M. S. ; Digiacomo, J. J. ; Kumbhani, R. ; Novikov, D. ; Hunter, J. ; Tsoli, M. ; Ziegler, D. S. ; Dirksen, U. ; Jäger, N. ; Balasubramanian, G. ; Kramm, C. M. ; Nathrath, M. ; Bielack, S. ; Baker, S. J. ; Zhang, J. ; McFarland, J. M. ; Getz, G. ; Aguet, F. ; Jabado, N. ; Witt, O. ; Pfister, S. ; Ligon, K. L. ; Hovestadt, V. ; Kleinman, C. L. ; Long, H. ; Jones, D. (Last author) ; Bandopadhayay, P. ; Phoenix, T. N.
FOXR2 is an epigenetically regulated pan-cancer oncogene that activates ETS transcriptional circuits.
Cancer research 82(17), 2980-3001 (2022) [10.1158/0008-5472.CAN-22-0671]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Herp, D. ; Ridinger, J. ; Robaa, D. ; Shinsky, S. A. ; Schmidtkunz, K. ; Yesiloglu, T. Z. ; Bayer, T. ; Steimbach, R. ; Herbst-Gervasoni, C. J. ; Merz, A. ; Romier, C. ; Sehr, P. ; Gunkel, P. N. ; Miller, A. ; Christianson, D. W. ; Oehme, I. ; Sippl, W. ; Jung, M.
First Fluorescent Acetylspermidine Deacetylation Assay for HDAC10 Identifies Selective Inhibitors with Cellular Target Engagement.
ChemBioChem 23(14), e202200180 (2022) [10.1002/cbic.202200180]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Schoelles, K. J. ; Federmann, Y. ; Kurz, P. ; Selt, F. ; Schupp, W. ; Lagrèze, W. ; Lang, S. J. ; Auw-Haedrich, C.
Aggressive fibromatosis in a child: a diagnostic challenge.
Pathology 54(7), 948-951 (2022) [10.1016/j.pathol.2021.12.300]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Krausert, S. (First author) ; Brabetz, S. (First author) ; Mack, N. L. ; Schmitt-Hoffner, F. ; Schwalm, B. ; Peterziel, H. ; Mangang, A. ; Holland-Letz, T. ; Sieber, L. ; Korshunov, A. ; Oehme, I. ; Jäger, N. ; Witt, O. ; Pfister, S. M. ; Kool, M. (Last author)
Predictive modeling of resistance to SMO inhibition in a patient-derived orthotopic xenograft model of SHH medulloblastoma.
Neuro-oncology advances 4(1), vdac026 (2022) [10.1093/noajnl/vdac026]2022 DBCoverage Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Khalid, U. (First author) ; Simovic, M. ; Hammann, L. A. ; Iskar, M. ; Wong, J. K. L. ; Kumar, R. ; Jugold, M. ; Sill, M. ; Bolkestein, M. ; Kolb, T. ; Hergt, M. ; Devens, F. ; Ecker, J. ; Kool, M. ; Milde, T. ; Westermann, F. ; Benner, A. ; Lewis, J. ; Dietrich, S. ; Pfister, S. M. ; Lichter, P. ; Zapatka, M. ; Ernst, A. (Last author)
A synergistic interaction between HDAC- and PARP inhibitors in childhood tumors with chromothripsis.
International journal of cancer 151(4), 590-606 (2022) [10.1002/ijc.34027]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Nemes, K. ; Johann, P. D. ; Steinbügl, M. ; Gruhle, M. ; Bens, S. ; Kachanov, D. ; Teleshova, M. ; Hauser, P. ; Simon, T. ; Tippelt, S. ; Eberl, W. ; Chada, M. ; Lopez, V. S. ; Grigull, L. ; Hernáiz-Driever, P. ; Eyrich, M. ; Pears, J. ; Milde, T. ; Reinhard, H. ; Leipold, A. ; van de Wetering, M. ; Gil-da-Costa, M. J. ; Ebetsberger-Dachs, G. ; Kerl, K. ; Lemmer, A. ; Boztug, H. ; Furtwängler, R. ; Kordes, U. ; Vokuhl, C. ; Hasselblatt, M. ; Bison, B. ; Kröncke, T. ; Melchior, P. ; Timmermann, B. ; Gerss, J. ; Siebert, R. ; Frühwald, M. C.
Infants and Newborns with Atypical Teratoid Rhabdoid Tumors (ATRT) and Extracranial Malignant Rhabdoid Tumors (eMRT) in the EU-RHAB Registry: A Unique and Challenging Population
Cancers 14(9), 2185 (2022) [10.3390/cancers14092185]2022 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Füzesi, M. V. ; Muti, I. H. ; Berker, Y. ; Li, W. ; Sun, J. ; Habbel, P. ; Nowak, J. ; Xie, Z. ; Cheng, L. L. ; Zhang, Y.
High Resolution Magic Angle Spinning Proton NMR Study of Alzheimer's Disease with Mouse Models.
Metabolites 12(3), 253 (2022) [10.3390/metabo12030253]2022 DBCoverage Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Doz, F. ; van Tilburg, C. M. ; Geoerger, B. ; Højgaard, M. ; Øra, I. ; Boni, V. ; Capra, M. ; Chisholm, J. ; Chung, H. C. ; DuBois, S. G. ; Gallego-Melcon, S. ; Gerber, N. U. ; Goto, H. ; Grilley-Olson, J. E. ; Hansford, J. R. ; Hong, D. S. ; Italiano, A. ; Kang, H. J. ; Nysom, K. ; Thorwarth, A. ; Stefanowicz, J. ; Tahara, M. ; Ziegler, D. S. ; Gavrilovic, I. T. ; Norenberg, R. ; Dima, L. ; De La Cuesta, E. ; Laetsch, T. W. ; Drilon, A. ; Perreault, S.
Efficacy and safety of larotrectinib in TRK fusion-positive primary central nervous system tumors.
Neuro-Oncology 24(6), 997-1007 (2022) [10.1093/neuonc/noab274]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Zeyen, P. ; Zeyn, Y. ; Herp, D. ; Mahmoudi, F. ; Yesiloglu, T. Z. ; Erdmann, F. ; Schmidt, M. ; Robaa, D. ; Romier, C. ; Ridinger, J. ; Herbst-Gervasoni, C. J. ; Christianson, D. W. ; Oehme, I. ; Jung, M. ; Krämer, O. H. ; Sippl, W.
Identification of histone deacetylase 10 (HDAC10) inhibitors that modulate autophagy in transformed cells.
European journal of medicinal chemistry 234, 114272 (2022) [10.1016/j.ejmech.2022.114272]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Gatzweiler, C. (First author) ; Ridinger, J. ; Herter, S. ; Gerloff, X. F. ; ElHarouni, D. ; Berker, Y. ; Imle, R. ; Schmitt, L. ; Kreth, S. ; Stainczyk, S. ; Ayhan, S. ; Najafi, S. ; Krunic, D. ; Frese, K. ; Meder, B. ; Reuss, D. ; Fiesel, P. ; Schramm, K. ; Blattner-Johnson, M. ; Jones, D. T. W. ; Banito, A. ; Westermann, F. ; Oppermann, S. ; Milde, T. ; Peterziel, H. ; Witt, O. ; Oehme, I. (Last author)
Functional Therapeutic Target Validation Using Pediatric Zebrafish Xenograft Models.
Cancers 14(3), 849 (2022) [10.3390/cancers14030849]2022 DBCoverage Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Gaab, C. ; Adolph, J. E. ; Tippelt, S. ; Mikasch, R. ; Obrecht, D. ; Mynarek, M. ; Rutkowski, S. ; Pfister, S. M. ; Milde, T. ; Witt, O. ; Bison, B. ; Warmuth-Metz, M. ; Kortmann, R.-D. ; Dietzsch, S. ; Pietsch, T. ; Timmermann, B. ; Sträter, R. ; Bode, U. ; Faldum, A. ; Kwiecien, R. ; Fleischhack, G.
Local and Systemic Therapy of Recurrent Medulloblastomas in Children and Adolescents: Results of the P-HIT-REZ 2005 Study
Cancers 14(3), 471 (2022) [10.3390/cancers14030471]2022 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Ghasemi, D. R. (First author) ; Fleischhack, G. ; Milde, T. ; Pajtler, K. (Last author)
The Current Landscape of Targeted Clinical Trials in Non-WNT/Non-SHH Medulloblastoma
Cancers 14(3), 679 (2022) [10.3390/cancers14030679]2022 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Ebrahimi, A. (First author) ; Korshunov, A. ; Reifenberger, G. ; Capper, D. ; Felsberg, J. ; Trisolini, E. ; Pollo, B. ; Calatozzolo, C. ; Prinz, M. ; Staszewski, O. ; Schweizer, L. ; Schittenhelm, J. ; Harter, P. ; Paulus, W. ; Thomas, C. ; Kohlhof-Meinecke, P. ; Seiz-Rosenhagen, M. ; Milde, T. ; Casalini, M. B. ; Suwala, A. ; Wefers, A. K. ; Reinhardt, A. ; Sievers, P. ; Kramm, C. M. ; Etminam, N. ; Unterberg, A. ; Wick, W. ; Herold-Mende, C. ; Sturm, D. ; Pfister, S. M. ; Sill, M. ; Jones, D. T. W. ; Schrimpf, D. ; Reuss, D. E. ; Aldape, K. ; Abdullaev, Z. ; Sahm, F. ; von Deimling, A. ; Stichel, D. (Last author)
Pleomorphic xanthoastrocytoma is a heterogeneous entity with pTERT mutations prognosticating shorter survival.
Acta Neuropathologica Communications 10(1), 5 (2022) [10.1186/s40478-021-01308-1]2022 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

ElHarouni, D. (First author) ; Berker, Y. ; Peterziel, H. ; Gopisetty, A. ; Turunen, L. ; Kreth, S. ; Stainczyk, S. A. ; Oehme, I. ; Pietiäinen, V. ; Jäger, N. ; Witt, O. ; Schlesner, M. ; Oppermann, S. (Last author)
iTReX: Interactive exploration of mono- and combination therapy dose response profiling data.
Pharmacological research 175, 105996 (2022) [10.1016/j.phrs.2021.105996]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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