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Nachwuchsgruppe Epithel-Mikrobiom-lnteraktionen

Dr. Jens Puschhof

Organ-Chips (oben) und Organoide (unten). Die Interaktionen von fluoreszenten Krebszellen (oben rechts) sowie Bakterien (unten links, grün) können im Detail studiert werden.
© dkfz.de

Unsere Nachwuchsgruppe Epithel-Mikrobiom-lnteraktionen untersucht, wie Bakterien zur Krebsentwicklung, Metastasierung und zum Therapieansprechen beitragen. Das Team besteht aus Krebsforschern, Bioengineering-Experten, Mikrobiologen und Bioinformatikern, die zusammenarbeiten, um Patienten zu helfen, indem sie die funktionellen Auswirkungen von Bakterien in menschlichen Tumoren entschlüsseln.

Anhand von Gewebeproben von Patienten isolieren wir Bakterienstämme und erstellen Organoide. Diese Modelle können mit zusätzlichen Merkmalen des menschlichen Darms auf USB-Stick-großen Geräten, "Organ-Chips", für detaillierte Studien kombiniert werden. Darüber hinaus transplantieren wir Organoid-Bakterien-Mischungen in Mausmodelle, um ihre Migration und Interaktion im Kontext des gesamten Organismus zu untersuchen.

In unserer einzigartigen Biobank am DKFZ charakterisieren wir sowohl Tumororganoide als auch tumorresidente Bakterienstämme durch Ganzgenomsequenzierung, Fluoreszenzmikroskopie und andere moderne Methoden. Basierend auf den vielfältigen Daten, die wir erhalten, entwickeln wir Hypothesen darüber, wie bestimmte Bakterienstämme Tumoren beeinflussen könnten. Mit unserem breiten Portfolio an Patientenmodellen und funktionellen Assays liegt unser Hauptaugenmerk auf der tiefgehenden Untersuchung dieser Zusammenhänge. In enger Zusammenarbeit mit unseren klinischen Partnern arbeiten wir an der raschen Translation unserer Erkenntnisse in neue mikrobiom-basierte Früherkennungs-, Präventions- und Behandlungsstrategien für Krebs.

Wenn Sie gerne in einem jungen Team mit flachen Hierarchien, einem kollaborativen Teamspirit und einem starken Interesse an der experimentellen Arbeit zur Krebsmikroumgebung arbeiten oder mit einem solchen zusammenarbeiten möchten, dann melden Sie sich gerne jederzeit!

Kontakt

Dr. Jens Puschhof
Epithel-Mikrobiom-lnteraktionen (D300)
Deutsches Krebsforschungszentrum
Im Neuenheimer Feld 280
69120 Heidelberg
Tel: +49 6221 42-4953

Ausgewählte Publikationen

  • Mutational signature in colorectal cancer caused by genotoxic pks+ E. coli. Pleguezuelos-Manzano C*, Puschhof J*, Rosendahl Huber A*, …, Cuppen E, van Boxtel R#, Clevers H#. Nature. 2020 Apr;580(7802):269-273. doi: 10.1038/s41586-020-2080-8.
  • Intestinal organoid co-cultures with microbes. Puschhof J*, Pleguezuelos-Manzano C*, Martinez-Silgado A, …, Dutta D, Heo I, Clevers H. Nature Protocols. 2021 Aug 11. doi: 10.1038/s41596-021-00589-z.
  • Improved detection of colibactin-induced mutations by genotoxic E. coli in organoids and colorectal cancer. Rosendahl Huber A*, Pleguezuelos-Manzano C*, Puschhof J*, Ubels J*, …, Cuppen E, Clevers H, van Boxtel R Cancer Cell. 2024 Mar 11;42(3):487-496.e6. doi: 10.1016/j.ccell.2024.02.009.
  • Intracellular bacteria in cancer – prospects and debates. Schorr L*, Mathies M*, Elinav E and Puschhof J. NPJ Biofilms Microbiomes. 2023 Oct 9;9(1):76. doi: 10.1038/s41522-023-00446-9.
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