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Arbeitsgruppe RNA-Protein Komplexe und Zellproliferation

PD Dr. Maïwen Caudron-Herger

Eine fehlerfreie Vollendung der Zellteilung ist entscheidend für die Wahrung der Genomintegrität
© dkfz.de

Einmal pro Zellzyklus stehen Zellen vor der anspruchsvollen Aufgabe, ihre Chromosomen in zwei identische Sätze aufzuteilen. Diese werden an ihre Tochterzellen weitergegeben. Obwohl die Zellteilung stark reguliert ist, können dabei Fehler auftreten, die entweder zum Zelltod oder zur Genominstabilität führen. Der Genominstabilität liegen menschlichen Krankheiten zugrunde.
Trotz erheblicher Fortschritte in der Zellbiologie sind die komplexen Prozesse, die die Zellteilung regulieren und vorantreiben, immer noch nicht vollständig verstanden. Dies bietet Möglichkeiten für Entdeckungen im Zusammenhang mit den Ursachen und Anfälligkeiten stark proliferativer Krankheiten wie Krebs.
RNA-Protein-Komplexe haben sich hierbei als entscheidende regulatorische Elemente in mehreren wichtigen zellulären Prozessen mit erheblicher Bedeutung für die Gesundheit und Krankheit herausgestellt. Dies macht sie zu attraktiven Zielen für die Forschung.
Unsere aktuellen Projekte befassen sich mit der zentralen Rolle von RNA und RNA-Protein-Komplexen bei der Koordination der funktionellen Zusammenstellung kritischer mitotischer Strukturen für die fehlerfreie Vollendung der Zellteilung. Durch die Integration der RNA-Komponente verleiht unser Ansatz der Analyse wichtiger Ereignisse in dieser grundlegenden Phase des Zellzyklus ein neues Maß an Komplexität.
Unser Ansatz zeichnet sich durch eine interdisziplinäre und kollaborative Herangehensweise aus. Er umfasst ein vielfältiges Spektrum an Methoden. Dazu gehören Immunpräzipitation zur Untersuchung von Protein-Protein-Wechselwirkungen, auf UV-Vernetzung und Immunpräzipitation (iCLIP) basierende Ansätze zur Untersuchung von Protein-RNA-Wechselwirkungen, Hochdurchsatzsequenzierung und bioinformatische Analysen zur Identifizierung interagierender RNA-Transkripte, sowie konfokale Mikroskopie-Bildgebung zur Lokalisierung von Proteinen, RNAs und ihrer Interaktionen.
Neben den Auswirkungen auf unser grundlegendes Verständnis der Zellteilung hat das neu erworbene Wissen großes Potenzial in innovative Krebstherapie-Strategien umgesetzt zu werden, indem es auf noch unerforschte zelluläre Funktionen, die mit spezifischen RNA-Protein-Wechselwirkungen verbunden sind, abzielt.

Die weiterführenden Seiten sind momentan nur auf Englisch verfügbar.

Kontakt

PD Dr. Maïwen Caudron-Herger
RNA-Protein Komplexe und Zellproliferation (B150)
Deutsches Krebsforschungszentrum
Im Neuenheimer Feld 280
69120 Heidelberg
Tel: +49 6221 42 4383

Ausgewählte Publikationen

  • Wassmer E, Koppány G, Hermes M, Diederichs S and Caudron-Herger M. Refining the pool of RNA-binding domains advances the classification and prediction of RNA-binding proteins. Nucleic Acids Res. 2024; gkae536, https://doi.org/10.1093/nar/gkae536
  • Caudron-Herger M*, Ralf E. Jansen, Elsa Wassmer and Sven Diederichs. RBP2GO: a comprehensive pan-species database on RNA-binding proteins, their interactions and functions. Nucleic Acids Res. 2021; 49:D425-436. *Corresponding author.
  • Caudron-Herger M*, Barreau E, Nasa I, Schultz A, Seiler J, Kettenbach AN and Diederichs S*. Identification, quantification and bioinformatic analysis of RNA-dependent proteins by RNase treatment and density gradient ultracentrifugation using R-DeeP. Nature Protocols. 2020; 15:1338-1370. *Corresponding authors.
  • Caudron-Herger M*, Rusin SF, Adamo ME, Seiler J, Schmid V, Barreau E, Kettenbach AN and Diederichs S*. R-DeeP: Proteome-wide and quantitative identification of RNA-dependent proteins by density gradient ultracentrifugation. Mol Cell. 2019; 75:184-199. *Corresponding authors.
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