Clinical Bioinformatics
Unsere Forschung
Unser Ziel ist es, die zelluläre Heterogenität und die molekularen Mechanismen von Krebserkrankungen im Kindesalter besser zu verstehen. Dazu entwickeln und nutzen wir computergestützte Methoden, um multizelluläre und räumliche Einzelzellinformationen zu analysieren. So identifizieren wir Muster und gewinnen wertvolle Erkenntnisse über Krankheitsmechanismen. Außerdem finden sie uns auch am KiTZ.
In den letzten Jahren haben wir leistungsstarke Analyseplattformen für Einzelzell-Studien entwickelt und arbeiten kontinuierlich an neuen Methoden zur DNA-Methylierungsanalyse und Klassifizierung. Durch enge Zusammenarbeit mit experimentellen Partnern setzen wir Einzelzell-Multiomik-Ansätze ein, um zentrale Fragen zur Krebsbiologie – wie etwa Therapieresistenz – zu untersuchen. Dabei liegt unser Fokus zunehmend auf Einzelzell-Genomik und Epigenomik, Zell-Zell-Interaktionen und alternativem Spleißen, einschließlich der Analyse von Immunzellen.
Ein weiterer Schwerpunkt ist die DNA-Methylierungsanalyse für eine präzisere Krebsdiagnose. Unser übergeordnetes Ziel ist es, ein tiefgreifendes Verständnis der Krankheitsmechanismen zu erlangen, um neue therapeutische Angriffspunkte zu identifizieren, die molekulare Diagnostik zu verbessern und innovative Behandlungsstrategien für Kinder mit Krebs zu entwickeln – gestützt auf modernste Einzelzell- und Raum-Omik-Technologien sowie computergestützte Biologie.
Unser Team
7 Mitarbeiter:innen
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Dr. Supat Thongjuea
Wissenschaftler
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Dr. Iman Sadeghi Dehchesmeh
Postdoc
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Karla Catacora Castaneda
Doktorandin
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Dr. Konstantin Okonechnikov
Wissenschaftler
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Dr. Martin Sill
Wissenschaftler
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Dr. Wencan Zhu
Postdoc
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Rolf Kabbe
IT Coordinator & Cluster Admin
Ausgewählte Publikationen
Wen WX, Mead AJ, Thongjuea S.
Rodriguez-Meira A, Norfo R, Wen S, Chédeville AL, Rahman H, …, Jacobsen SEW, Psaila B, Thongjuea S, Antony-Debré I, Mead AJ.