Clinical Bioinformatics

Ein Mann mit schwarzem, kurzem Haar steht an einem Geländer. Er trägt ein hellblaues Hemd und dunkelblaue Hose. Der Hintergrund zeigt verschwommene Gebäude und Grünflächen, die auf eine urbane Umgebung hinweisen. Der Mann hat einen freundlichen Ausdruck.

Dr. Supat Thongjuea

Group Leader

The Clinical Bioinformatics group investigates the molecular characteristics of individual cancer cells, using single-cell technologies and computational biology to identify therapeutic targets for pediatric cancers.

Our research

Our research aims to understand better cellular heterogeneity and the molecular mechanisms underlying childhood cancers. To achieve this, we leverage computational methods and comprehensive single-cell multiomics analyses, including spatial data, to uncover the molecular characteristics of individual cancer cells. We seek to uncover why some cancer cells develop resistance to treatment, leading to relapse, and to identify the most effective therapeutic strategies for pediatric cancer patients. You can also find us at the KiTZ.

Our team specializes in developing cutting-edge computational methodologies, leveraging machine learning and AI to enhance cancer diagnosis, classification, and drug response prediction. Through close collaborations with experimental lab partners, we apply single-cell multiomics approaches to tackle critical questions in cancer biology, such as therapy resistance. We are also a key contributor to the HEROES-AYA consortium (https://www.heroes-aya.de), where our emphasis lies in utilizing single-cell approaches to gain insights into tumor heterogeneity and the development of treatment resistance in sarcomas. Our long-term vision is to identify therapeutic targets through single-cell technologies and computational biology and advance drug discovery by applying AI-driven methodologies for pediatric cancers.

Our team

  • Ein Mann mit schwarzem, kurzem Haar steht an einem Geländer. Er trägt ein hellblaues Hemd und dunkelblaue Hose. Der Hintergrund zeigt verschwommene Gebäude und Grünflächen, die auf eine urbane Umgebung hinweisen. Der Mann hat einen freundlichen Ausdruck.

    Dr. Supat Thongjuea

    Group leader

  • Employee image

    Dr. Konstantin Okonechnikov

    Staff scientist

  • Employee image

    Dr. Piyush Kumar Joshi

    Postdoc

  • Employee image

    Dr. Wencan Zhu

    Postdoc

  • Employee image

    Nada Abdelgawad

    PhD student

  • Employee image

    Nouhaila Benhdidou

    PhD student

  • Eine lächelnde Frau steht an einem Geländer. Sie trägt eine weiße Bluse und einen farbigen Rock mit grafischem Muster. Im Hintergrund sind uneindeutige, unscharfe Farben zu sehen, die eine moderne Umgebung andeuten.

    Karla Catacora Castaneda

    PhD student

  • Porträt eines Mannes mit grauem, langen Haar und einem Bart. Er trägt ein schwarzes Poloshirt und steht vor einem unscharfen Hintergrund. Der Gesichtsausdruck ist neutral.

    Rolf Kabbe

    IT Coordinator & Cluster Admin

Selected publications

2024 - https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.09.579690v1.full
2023 - Nucleic Acids Res . 2023 Mar 21;51(5):e29
2021 - Cell Reports Volume 36, Issue 11, 14 September 2021, 109698
2017 - Nat Med 2017 Jun;23(6):692-702

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Ein Mann mit schwarzem, kurzem Haar steht an einem Geländer. Er trägt ein hellblaues Hemd und dunkelblaue Hose. Der Hintergrund zeigt verschwommene Gebäude und Grünflächen, die auf eine urbane Umgebung hinweisen. Der Mann hat einen freundlichen Ausdruck.

Dr. Supat Thongjuea

Wissenschaftler
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